Encravado na Serra da Mantiqueira, a uma altitude que ultrapassa 1.150 m. nos pontos mais elevados, o município possui uma área de 322 Km² e está inserido na região denominada “Entre Serras e Águas”.
Nazaré Paulista limita-se ao Norte e a Noroeste com Piracaia, ao Sul com Mairiporã, a Leste com Igaratá e Santa Isabel, a Oeste com Bom Jesus dos Perdões, a Sudeste com Guarulhos e a Sudoeste com Atibaia.
